Dans l'une des études les plus vastes, les plus longues et les plus complètes sur les infections virales respiratoires chez l'homme, Murcia et ses collègues ont utilisé un test PCR capable d'identifier les membres de 11 familles virales pour sonder les échantillons nasaux et de gorge de plus de 36 000 personnes qui ont demandé des soins au National Health Service de Glasgow pendant 9 ans. Parmi d'autres exemples d'interférence virale, leurs données ont clairement montré que le rhinovirus et la grippe A ont atteint leur pic à des moments différents, démontrant une "interaction négative" entre les deux virus, a conclu le groupe dans le numéro du 26 décembre 2019 du. Actes de l'Académie nationale des sciences.
L'année suivante, Foxman et ses collègues ont rapporté avoir trouvé des interférences après des tests PCR pour 10 virus différents dans 13 000 échantillons respiratoires d'adultes ayant consulté le système hospitalier de Yale New Haven. Entre 2016 et 2019, environ 7 % des personnes ont été testées positives pour le rhinovirus ou le virus de la grippe A, mais sur ces 1911 échantillons, seuls 12 présentaient les deux virus, soit nettement moins que prévu, ont-ils rapporté dans le . The Lancet Microbe. "C'était génial de voir l'article d'Ellen Foxman", dit Murcia. "Elle a essentiellement montré des résultats similaires aux nôtres, et ce sont des études complètement indépendantes".
Dans le même rapport, Foxman a mis en évidence le rôle causal des interférons. Comme les voies respiratoires normales, les organoïdes fabriqués par son équipe à partir de cellules épithéliales bronchiques présentent des réponses immunitaires, notamment la sécrétion d'interférons. L'infection des organoïdes par un rhinovirus a pratiquement stoppé la croissance des virus de la grippe A ajoutés ultérieurement. L'étude montre que les infections à rhinovirus ont entraîné l'expression d'un grand nombre de gènes liés aux interférons. Et lorsque l'équipe de la chercheuse a traité les organoïdes avec des médicaments qui empêchaient leurs cellules de répondre à l'interféron, les virus de la grippe ont prospéré.
Aujourd'hui, les chercheurs en interférence virale surveillent de près le plus récent virus respiratoire à faire le tour du monde. "Quelles interactions le SRAS-CoV-2 pourrait-il avoir avec d'autres virus ?" demande Murcia. "À ce jour, il n'existe pas de données épidémiologiques robustes". D'une part, la distanciation sociale généralisée et le port de masques dans de nombreux pays signifiaient qu'il y avait peu de chances de voir les interférences en action. "Il n'y a pratiquement pas eu de circulation d'autres virus respiratoires au cours des trois premières années de la pandémie", précise M. Boivin. En outre, le SRAS-CoV-2 possède de nombreuses défenses contre les interférons, notamment en empêchant leur production, ce qui pourrait affecter ses interactions avec d'autres virus.
Néanmoins, Foxman a publié des preuves que, dans son modèle organoïde, le rhinovirus peut interférer avec le SRAS-CoV-2. Et l'équipe de Boivin a signalé que la grippe A et le SRAS-CoV-2 peuvent chacun bloquer l'autre dans des études cellulaires.
