Article de Lalita Panicker, rédactrice consultante, Views et rédactrice, Insight, Hindustan Times, New Delhi.
Il y a quelques semaines, les journalistes se sont empressés de rapporter des preuves génétiques non divulguées auparavant, selon lesquelles des mammifères vendus au marché de gros des fruits de mer de Huanan à Wuhan, en Chine - peut-être des chiens viverrins - pourraient avoir déclenché la pandémie de COVID-19. Mais au grand dam des chercheurs qui ont transmis confidentiellement leurs conclusions à un groupe consultatif de l'OMS ( World Health Organization ) le 14 mars, la nouvelle est tombée avant la fin de l'année. le 14 mars, la nouvelle est tombée avant qu'ils n'aient fini d'analyser les données, qui consistent en des séquences d'ARN et d'ADN recueillies sur le marché au début de 2020. www.science.org/content/article/covid-origin-report-controversy
La semaine dernière, cependant, ils ont publié leur rapport complet de 22 pages. de 22 pages sur Zenodo, un dépôt ouvert de recherche scientifique.
Pour les auteurs du rapport, 19 biologistes évolutionnistes de six pays, ces données confirment la théorie selon laquelle les mammifères sensibles au SRAS-CoV-2 se trouvaient au bon endroit au bon moment pour transmettre le virus à l'homme, déclenchant ainsi la pandémie. Ces spécialistes et d'autres, dont le directeur général de l'OMS, ont reproché à la Chine pour ne pas avoir communiqué plus tôt les données du marché de Wuhan.
Mais les critiques, dont beaucoup soupçonnent le SRAS-CoV-2 de s'être échappé de l'Institut de virologie de Wuhan (WIV), affirment que les nouvelles séquences n'apportent rien de plus que la confirmation que le marché des fruits de mer vendait aussi des mammifères. Selon le biologiste informatique Erik van Nimwegen, il est "tout simplement absurde" de suggérer qu'il s'agit d'une preuve que les animaux ont été infectés par le SRAS-CoV-2 et l'ont transmis à l'homme. Dans une lettre de 2021 lettre dans ScienceErik van Nimwegen et 17 autres scientifiques, dont les deux auteurs du nouveau rapport, ont appelé à un "examen équilibré" de l'hypothèse de la fuite en laboratoire.
Plusieurs des coauteurs du nouveau rapport ont publié deux articles dans Science en 2022, qui attribuaient l'origine de la pandémie aux mammifères vendus sur le marché de Wuhan, soulignant qu'il s'agissait de l'un des quatre endroits de la ville où l'on vendait des animaux sauvages susceptibles d'être contaminés par le SRAS-CoV-2. Ces conclusions sont renforcées par le nouveau rapport, affirment ses auteurs. "Ces arguments contrastent fortement avec l'absence de preuves de l'existence d'une autre voie d'émergence du SRAS-CoV-2", concluent-ils dans leur rapport.
La science examine certaines des questions clés.
Comment les données de 2020 ont-elles été trouvées ?
En juin 2022, des chercheurs chinois ont téléchargé les données de séquençage de leurs échantillons de marché sur GISAID, une base de données virologiques, à l'appui d'un article préliminaire qu'ils avaient publié quelques mois plus tôt. Les données étaient à l'origine cachées aux autres utilisateurs de GISAID, mais elles sont devenues accessibles en janvier. Florence Débarre, biologiste évolutionniste au CNRS, l'agence nationale française de recherche, qui s'est fait connaître sur les médias sociaux pour ses analyses des données de COVID-19 et ses prises de bec avec les partisans des fuites de laboratoire, explique qu'elle est tombée par hasard sur les séquences et qu'elle les a partagées avec ses collègues. Leur analyse a mis en évidence l'existence de mammifères sensibles aux coronavirus sur le marché.
Le lendemain du jour où Débarre et ses collègues ont fait part de leurs découvertes à un membre de l'équipe chinoise, la GISAID a rendu les données invisibles, apparemment à la demande de l'auteur. Dans le rapport Zenodo, les chercheurs déclarent que leur analyse "n'est pas destinée à être publiée dans une revue" et qu'elle n'a pas pour but d'éclipser l'article de l'équipe chinoise. de l'équipe chinoiseL'article de l'équipe chinoise, qui est en cours d'examen par la revue Nature qui est en cours d'examen par la famille de revues Nature. Comme l'explique le rapport, ils ont téléchargé les données mais ne les rendent pas encore publiques dans l'espoir que les chercheurs chinois le feront bientôt.
Que disent les données génétiques contenues dans le rapport ?
Les chercheurs chinois, ainsi que le gouvernement chinois, ont hésité sur la question de savoir si des mammifères étaient en vente sur le marché. Les nouvelles données fournissent sans doute la preuve la plus solide à ce jour que les principales espèces sensibles au SRAS-CoV-2 se trouvaient là lorsque le COVID-19 est apparu. L'équipe chinoise qui a visité le marché en 2020 a prélevé 923 "échantillons environnementaux" dans les conteneurs, sur les surfaces et dans les égouts des étals du marché. Dans leur rapport, Débarre et ses collègues indiquent que 49 de ces échantillons infectés par l'ARN du SRAS-CoV-2 contenaient également de l'ADN mitochondrial (ADNmt) qui identifiait clairement cinq mammifères : le chien viverrin commun, le porc-épic malais, le hérisson de l'Amour, la civette palmiste masquée et le rat des bambous. Ils ont également trouvé d'autres ADN, ainsi que de l'ARN provenant des mammifères. "La cooccurrence du virus du SRAS-CoV-2 et de l'ARN/ADN d'animaux sensibles dans les mêmes échantillons, dans une section spécifique du marché de Huanan, et souvent en plus grande abondance que le matériel génétique humain, identifie ces espèces, en particulier le chien viverrin commun, comme les conduits les plus probables pour l'émergence du SRAS-CoV-2 à la fin de 2019", écrivent les auteurs. Le groupe a produit une "carte thermique" qui montre que la densité du SRAS-CoV-2 était "la plus élevée" dans les zones de marché près des étals qui vendaient les mammifères.
Des expériences ont montré que le SRAS-CoV-2 infecte facilement les chiens viverrins - couramment élevés pour leur fourrure en Chine, mais aussi vendus pour leur viande dans des marchés "humides" comme celui de Wuhan - et qu'ils excrètent des niveaux élevés du virus. Le rapport décrit la découverte d'ADNmt de chien viverrin dans six échantillons provenant de deux étals différents du marché de Wuhan. Un échantillon provenant d'un chariot testé positif au SRAS-CoV-2 présentait également un matériel génétique "abondant" de chien viverrin. Le même échantillon contenait beaucoup moins de matériel génétique humain. Selon les chercheurs, cela suggère - mais ne prouve pas - que le chien viverrin ou les chiens sur le chariot étaient plus susceptibles de transmettre le virus que les humains travaillant à l'étal ou faisant leurs courses à proximité. Lorsqu'ils ont comparé l'ADNmt des échantillons prélevés sur le marché avec ceux précédemment signalés par d'autres scientifiques, la correspondance la plus proche provenait d'un chien viverrin sauvage, distinct de la sous-espèce élevée pour sa fourrure. Si les chiens viverrins ont introduit le virus sur le marché, les chercheurs qui étudient les origines de COVID-19 devraient se tourner vers le commerce des animaux sauvages en Chine, et non vers les élevages de fourrure.
Que disent les autres scientifiques des nouvelles séquences découvertes ?
Sur la base d'entretiens...ScienceInsider a contacté les 18 auteurs d'une lettre datant de 2021 demandant un "examen équilibré" de l'hypothèse de la fuite de laboratoire - et les réactions des médias sociaux, les nouveaux résultats ont persuadé certains chercheurs que les animaux du marché étaient la source probable du SRAS-CoV-2. Mais pour la plupart d'entre eux, cela n'a pas changé leur position dans le débat sur l'origine de la maladie. Des divergences subsistent également sur la pertinence de l'analyse des données chinoises par Débarre et ses collègues. Certains, qui étaient d'accord avec le directeur général de l'OMS pour dire que les chercheurs chinois auraient dû partager les données depuis longtemps, ont applaudi la tentative du groupe de forcer la divulgation des séquences de marché, tandis que d'autres ont mis en doute l'éthique de discuter des données avant que l'équipe chinoise ne publie son propre article.
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L'Initiative mondiale pour l'éradication de la poliomyélite (IMEP) a signalé la semaine dernière que sept enfants africains, six en République démocratique du Congo et un au Burundi, ont été récemment paralysés par des souches de poliovirus dérivées d'une nouvelle version du vaccin antipoliomyélitique oral vivant Albert Sabin©. www.science.org/content/article/news-glance-modernizing-bed-nets-iding-solar-system-visitor-and-health-lessons
Il s'agit des premiers cas liés au vaccin, le nouveau vaccin antipoliomyélitique oral de type 2 (nOPV2), qui a été génétiquement modifié pour éviter ce problème. Des souches dérivées du vaccin peuvent apparaître dans des endroits où les taux de vaccination sont faibles et le virus vaccinal affaibli peut continuer à se propager d'une personne à l'autre et revenir à sa forme paralytique. Depuis le lancement du VPOn2 il y a deux ans, l'IMEP a administré près de 600 millions de doses en réponse à des épidémies dans 28 pays. Les experts affirment que ces réversions, bien que décevantes, semblent extrêmement rares et que le vaccin semble beaucoup plus stable sur le plan génétique que son prédécesseur. Ils ajoutent que les nouveaux cas soulignent la nécessité d'augmenter la couverture vaccinale afin d'éviter que de telles réversions ne se produisent.
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Les agences de renseignement américaines doivent déclassifier les informations relatives à l'Institut chinois de virologie de Wuhan (WIV) et à l'origine de la pandémie COVID-19 dans un délai de 90 jours, selon un projet de loi signé le 20 mars par le président Joe Biden. le 20 mars par le président Joe Biden. www.science.org/content/article/news-glance-modernizing-bed-nets-iding-solar-system-visitor-and-health-lessons
Les deux chambres du Congrès ont adopté le projet de loi de déclassification avec un fort soutien bipartisan. Le WIV a fait l'objet d'un examen minutieux en raison de sa longue expérience de travail avec des coronavirus de chauves-souris, dont un cousin éloigné du SRAS-CoV-2, à l'origine de la pandémie. Certains soupçonnent le WIV d'avoir accidentellement libéré le virus, peut-être après avoir modifié une souche de chauve-souris pour qu'elle soit plus infectieuse chez l'homme. Les agences de renseignement américaines ont fourni des évaluations contradictoires sur cette possibilité, mais n'ont divulgué que peu de données à l'appui de leurs conclusions. La loi demande des détails sur les chercheurs du WIV qui auraient contracté une maladie respiratoire à l'automne 2019, avant qu'une épidémie de COVID-19 n'apparaisse clairement à Wuhan en décembre.
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Deux vaccins testés par un centre de recherche vétérinaire néerlandais se sont révélés efficaces contre la grippe aviaire hautement infectieuse lors d'une première expérience menée dans un environnement contrôlé, a déclaré le gouvernement néerlandais vendredi. www.medscape.com/viewarticle/989879?src=wnl_edit_tpal&uac=398271FG&impID=5266608&faf=1
"Non seulement les vaccins ont protégé les volailles utilisées en laboratoire contre les symptômes de la maladie, mais ils ont également empêché la propagation de la grippe aviaire", a déclaré le gouvernement dans un communiqué. Un vaccin a été produit par la société française Ceva Animal Health et l'autre par la société allemande Boehringer Ingelheim, selon un document officiel publié sur le site web du gouvernement néerlandais. La grippe aviaire s'est propagée dans le monde entier l'année dernière, tuant plus de 200 millions d'oiseaux, dont six millions rien qu'aux Pays-Bas, faisant grimper en flèche le prix des œufs et suscitant l'inquiétude des gouvernements quant à la transmission de la maladie à l'homme.
Certains pays, dont la Chine, vaccinent déjà contre la grippe aviaire et, comme le virus semble être devenu endémique, d'autres gouvernements du monde entier qui s'étaient opposés aux vaccins reconsidèrent leur position. Leur opposition était motivée par la crainte qu'un vaccin ne masque la propagation de la grippe aviaire, mais des tests indiquent que ce ne serait pas le cas avec les deux vaccins testés aux Pays-Bas. Dans le cadre d'un programme européen, les Pays-Bas ont testé des vaccins contre la grippe aviaire sur des poules pondeuses, tandis que la France effectue des tests sur des canards, l'Italie sur des dindes et la Hongrie sur des canards de Pékin. La plupart de ces tests sont basés sur des vaccins existants et adaptés à la souche H5N1 qui se propage en Europe. La Wageningen Bioveterinary Research, située au nord-est d'Amsterdam, a testé quatre vaccins pour poulets avant de sélectionner ceux de Ceva Animal Health et de Boehringer Ingelheim. Les deux autres vaccins testés ont été produits respectivement par la société bulgare Huvepharma et Merck Sharp & Dohme (MSD), selon le document officiel. "Je suis heureux que nous disposions de deux vaccins avec lesquels nous pouvons faire avancer le processus de vaccination contre la grippe aviaire. Je mets en place les prochaines étapes aussi rapidement que possible, mais de manière responsable (...)", a déclaré le ministre néerlandais de l'agriculture, Piet Adema, dans le communiqué. Un essai sur le terrain sera lancé pour vérifier si les vaccins qui fonctionnent en laboratoire sont également efficaces s'ils sont appliqués dans des conditions plus larges. L'essai devrait durer plus d'un an afin de déterminer la durée de l'immunité des poulets après la vaccination.
